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[已解决] 偏最小二乘判别分析,PLS-DA

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现在在做生物数据数据处理,数据是代谢组方面的,目前用的方法如题:PCA和PLS-DA(下一步还打算用神经网络和支持向量机),PCA已经做的差不多了,程序和资料也是在本论坛搜集咨询然后自己又做点改动,在这里要特别感谢本论坛,每次提问都有热心的朋友同学老师回答,非常喜欢这论坛!
          现在在研究编写PLS-DA算法,对这算法现在很糊涂,有没有哪位高手已经成功编出该程序可以交流下程序,多谢了。我把PCA做的效果图贴在下面了(草图),供参考。
PCA是无监督的学习,PLS-DA是有监督的学习。
求PLS-DA程序代码,万分感谢!(主要目的是对数据进行分类)时限要到了,还没编出来程序。。痛苦。。。OMG.Orz..

PCA,分四类

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 楼主| 发表于 2012-9-24 10:03:55 | 显示全部楼层
这是部分数据,目的是要分两类。列是样本,共16个样本,分两类,每一类8个样品,用PLS-DA.......谢谢....

data-两类.xls

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发表于 2012-11-15 10:27:27 | 显示全部楼层
:victory: 我做的跟你差不多  然后思路都差不多……做PCA,你的data 应该倒置吧 。草图是得分图吧,里面100多个点是指标还是样本? 我也在求plsda代码

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 楼主| 发表于 2013-7-14 10:55:00 | 显示全部楼层 |此回复为最佳答案
额,发这个帖子原来已经1年了,时间过的真快啊,我也完成了自己的使命:)   时光荏苒~

依然是:主成分分析法PCA、偏最小二乘法PLS、正交偏最小二乘法OPLS、等距映射算法/流行学习ISOMAP

LCMS 组合图.png
ISOMAP-ARCH-预测-1 - 副本.jpg
LCMS SCORE - 副本.jpg
LCMS SCORE 3D - 副本.jpg
LCMS-OPLS-三维得分图-2 - 副本.jpg

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发表于 2013-8-30 07:58:42 | 显示全部楼层
算法原代码提供提供呀

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发表于 2013-9-7 16:48:22 | 显示全部楼层

恭喜楼主,怎么后来没做神经网络和支持向量机呢~~

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发表于 2013-9-12 09:23:00 | 显示全部楼层
楼主能提供源代码吗?

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发表于 2014-3-6 16:21:04 | 显示全部楼层
您能把你的PCA代码发给我看下吗?:)

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发表于 2014-3-21 10:13:42 | 显示全部楼层
同求源代码

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发表于 2014-4-15 14:33:40 | 显示全部楼层
求PLS代码:)
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