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发表于 2017-7-27 09:28:11 来自手机 | 显示全部楼层
王立娜 发表于 2017-7-27 08:44
各位大神,本人想计算一张荧光染色图片中每个细胞的荧光强度值,其中背景是一定要扣除的,有没有好心人指点 ...

很难完全分割好,你自己可以多试试
来自: 微社区

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发表于 2017-7-27 10:42:21 | 显示全部楼层
太暗的肯定不太好提,不过你这里面特别暗的不多,如果你想完美提取每一个肯定麻烦,不过要是要求不过就很简单了。
  1. close all
  2. aa = imread('test1.jpg');
  3. ag = aa(:,:,2);
  4. figure('name' , 'G');
  5. imshow(ag);
  6. a2 = (ag>100);
  7. a3 = (ag>70);
  8. a4 = bwareaopen(a3 , 2000);
  9. a5 = xor(a4 , a3);
  10. a5 = bwareaopen(a5 , 20);
  11. a6 = a5|a2;
  12. a3 = (ag>60);
  13. a4 = bwareaopen(a3 , 3000);
  14. a5 = xor(a4 , a3);
  15. a5 = bwareaopen(a5 , 20);
  16. a7 = a5|a6;
  17. a8 = imopen(a7 , true(3,3));
  18. a9 = imclose(a8 , true(4,4));
  19. figure('name' , 'a9');
  20. imshow(a9);
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发表于 2017-7-27 15:00:23 | 显示全部楼层
荧光强度值?是指荧光细胞的像素值?

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 楼主| 发表于 2017-7-27 15:27:53 | 显示全部楼层
Angla2016 发表于 2017-7-27 09:28
很难完全分割好,你自己可以多试试

感谢您的回复~

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 楼主| 发表于 2017-7-27 15:28:45 | 显示全部楼层
ylc5177146 发表于 2017-7-27 15:00
荧光强度值?是指荧光细胞的像素值?

是的,像素值就可以,反应其强度即可。

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 楼主| 发表于 2017-7-27 15:51:01 | 显示全部楼层
本帖最后由 王立娜 于 2017-8-1 11:54 编辑
zhangqinghao 发表于 2017-7-27 10:42
太暗的肯定不太好提,不过你这里面特别暗的不多,如果你想完美提取每一个肯定麻烦,不过要是要求不过就很简 ...

11111111111111111111111111111111111

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发表于 2017-7-27 16:15:12 | 显示全部楼层
王立娜 发表于 2017-7-27 15:51
非常感谢您的回复,我只需要一部分细胞来计算荧光值就可以。然后我按照你的代码输入,最后得到这张图片。 ...

分割都帮你分割好了,居然还不会,你这是一点基础都没有啊。。。你自己想办法吧,我现在没时间。

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 楼主| 发表于 2017-7-27 17:15:33 | 显示全部楼层
zhangqinghao 发表于 2017-7-27 16:15
分割都帮你分割好了,居然还不会,你这是一点基础都没有啊。。。你自己想办法吧,我现在没时间。 ...

我的确是没有基础,,,以前没有接触过,现在实验需要这个软件处理,其他师兄师姐也没有会的,,,总之谢谢了~

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发表于 2017-7-27 17:38:41 | 显示全部楼层
王立娜 发表于 2017-7-27 15:28
是的,像素值就可以,反应其强度即可。

那何必写那么多程序
随便找到一个细胞的中心位置
在MATLAB直接输出相应坐标的灰度值不就行了?
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